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DNA做的“硬盤(pán)”,你想擁有嗎

2025-02-17 09:42
來(lái)源:半月談網(wǎng)

半月談?dòng)浾?張漫子

以信息時(shí)代的后見(jiàn)之明回望人類(lèi)演化,我們的文明史,其實(shí)也是一部數(shù)據(jù)史。

在全球80億人平均每人每天產(chǎn)生高達(dá)1.5GB數(shù)據(jù)的今天,“數(shù)據(jù)怎么存、存在哪里好”的問(wèn)題,日益凸顯。要一塊多大的“硬盤(pán)”,才能裝下我們不斷延長(zhǎng)的文明史?答案可能在生命最基礎(chǔ)的單元之中。對(duì),就是DNA。DNA做的“硬盤(pán)”,你想擁有嗎?

DNA,能當(dāng)“硬盤(pán)”用?

DNA,攜帶生命核心“代碼”的神秘大分子。它有著經(jīng)典而美麗的雙螺旋結(jié)構(gòu),猶如無(wú)限綿延的莫比烏斯帶,編織出生命體演化的壯闊歷史。生命體規(guī)模巨大的遺傳信息就在此進(jìn)程中代代傳承,精準(zhǔn)而安穩(wěn),從信息科學(xué)的角度看,確實(shí)不可思議——單個(gè)人體細(xì)胞的平均直徑僅有5到200微米,卻輕松包羅一個(gè)人的全部遺傳信息,30億對(duì)堿基。

DNA可以保存多久?最新答案是200萬(wàn)年。近年科學(xué)家曾從格陵蘭島凍土中成功提取200萬(wàn)年前的DNA序列,其中信息仍歷歷可辨。

既然DNA攜帶的信息可跨越數(shù)百萬(wàn)年之久,那么今天我們這個(gè)信息爆炸的時(shí)代,能否借用這條生命史的莫比烏斯帶保存人間訊息,使之成為接續(xù)人類(lèi)文明的一條紐帶?

大膽假設(shè),自然要小心求證。我們先來(lái)看看,DNA為什么這么能“裝”?

關(guān)鍵在于兩方面。其一就是雙螺旋結(jié)構(gòu)。“這樣的結(jié)構(gòu)使DNA分子在甚小空間內(nèi)也可以緊湊排列,承載極高密度的信息?!北本┐髮W(xué)軟件研究所副研究員張成解釋道。

北京大學(xué) DNA 存儲(chǔ)研究團(tuán)隊(duì)在做試驗(yàn)

此外,DNA四種堿基(腺嘌呤A、胞嘧啶C、鳥(niǎo)嘌呤G和胸腺嘧啶T)的排列組合變化無(wú)窮,也就意味著它們可以編碼幾乎無(wú)限量的信息,使得DNA理論上具備比任何現(xiàn)有存儲(chǔ)設(shè)備更高的存儲(chǔ)容量。

DNA究竟有多能“裝”?理論上,僅1克DNA就能夠存儲(chǔ)約1000萬(wàn)小時(shí)的高清視頻數(shù)據(jù),想想看,1千克DNA又能裝下多少?

2023年,我國(guó)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)總量達(dá)32.85澤字節(jié)(ZB),相當(dāng)于1000多萬(wàn)座中國(guó)國(guó)家圖書(shū)館的數(shù)字資源總量。折合成我們更熟悉的單位GB,我國(guó)每天產(chǎn)生的數(shù)據(jù)量達(dá)到驚人的900億GB。據(jù)國(guó)際機(jī)構(gòu)估計(jì),剛過(guò)去的2024年,全球生成數(shù)據(jù)有159.2ZB之多。如果僅憑數(shù)據(jù)中心來(lái)存儲(chǔ),我們要建多少座數(shù)據(jù)中心才能儲(chǔ)存這些數(shù)據(jù)!

尋找體積更小、容量更大的存儲(chǔ)介質(zhì),已經(jīng)是迫在眉睫之事。DNA,能夠接過(guò)接力棒嗎?

把數(shù)據(jù)刻進(jìn)DNA

把海量數(shù)據(jù)存入DNA,也就三步。

第一步,將數(shù)據(jù)寫(xiě)入DNA,也就是將今日信息世界通行的二進(jìn)制數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為DNA序列,0和1不同的排列組合實(shí)現(xiàn)的多樣編碼,與DNA序列四種堿基遵循一定之規(guī)的排列,二者之間要想轉(zhuǎn)化無(wú)礙,就要制定嚴(yán)謹(jǐn)?shù)木幋a規(guī)則,比如,每2個(gè)二進(jìn)制位對(duì)應(yīng)1種核苷酸組合。

接下來(lái),構(gòu)建存儲(chǔ)信息的DNA分子。也就是按照前一步獲得的編碼布置堿基,合成DNA鏈。只不過(guò),目前常用的化學(xué)合成法效率還嫌低了些,科學(xué)家正在積極探求新方法,利用DNA聚合酶催化的酶促合成法,就為許多科學(xué)家所看好。還有科學(xué)家提出并行寫(xiě)入DNA信息。近期,北京大學(xué)團(tuán)隊(duì)利用“分子活字印刷”方法,實(shí)現(xiàn)了27.5萬(wàn)比特的平行DNA存儲(chǔ)。

最后,就是存儲(chǔ)與讀取了。DNA存儲(chǔ)對(duì)環(huán)境的要求,不外低溫、干燥、避光,低溫(一般為零下20攝氏度甚至更低)的干燥環(huán)境能減緩DNA分子的降解速度,避光則是為了防止光照引發(fā)DNA分子損傷,確保存儲(chǔ)數(shù)據(jù)不會(huì)“變質(zhì)”。

給DNA“硬盤(pán)”一點(diǎn)耐心

前面提到,DNA存儲(chǔ)不僅存得久,而且存得牢,若能有效避免水分與紫外線的影響,DNA可以在數(shù)十萬(wàn)年內(nèi)保持穩(wěn)定不變。

更妙的是,DNA存儲(chǔ)還是一種“低碳之選”。DNA存儲(chǔ)額外耗能極低,理想保存環(huán)境與日常環(huán)境相差不大,要想在能源有限條件下實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的長(zhǎng)期保存,DNA存儲(chǔ)堪稱(chēng)首選。

并行分子印刷 DNA 存儲(chǔ)示意圖

但是,在今天談DNA存儲(chǔ),還是一種憧憬,我們也需要明白,有幾樣問(wèn)題若不解決,DNA存儲(chǔ)還是不能成為我們的下一代主流存儲(chǔ)。

——成本高昂。目前合成2MB的DNA數(shù)據(jù)需要7000美元,讀取數(shù)據(jù)需要再加2000美元,如果以DNA形式存儲(chǔ)1GB大小的電影,編碼大約需要花費(fèi)358萬(wàn)美元。

——讀寫(xiě)速度太慢。以目前的技術(shù)合成DNA,每添加一個(gè)堿基大約需要0.1秒鐘。別覺(jué)得這時(shí)間不長(zhǎng),以此速度,保存一首高音質(zhì)的MP3歌曲都需要差不多1個(gè)月。

——讀取準(zhǔn)確率還不夠高。寫(xiě)入過(guò)程可能出現(xiàn)不正確的情況,讀取時(shí)也可能因測(cè)序誤差導(dǎo)致還原數(shù)據(jù)不準(zhǔn)確。分子數(shù)據(jù)不比完全虛擬的0與1,自身難免有瑕疵,若不找到合適的處理辦法,DNA存儲(chǔ)的精度會(huì)大打折扣。

革命性的技術(shù),往往起于看似幼稚的嘗試,人類(lèi)文明史無(wú)數(shù)轉(zhuǎn)折點(diǎn)都佐證了這一點(diǎn)。如果整部人類(lèi)文明史承傳賡續(xù)的方式,都可以來(lái)一個(gè)大進(jìn)步,那么我們又有什么理由不對(duì)今天的探索多些耐心呢?在傳遞地球生命的莫比烏斯帶上,刻下萬(wàn)物靈長(zhǎng)探索與創(chuàng)造的證明,會(huì)是智慧生命演化史上激動(dòng)人心的時(shí)刻。

編輯:范鐘秀

責(zé)任編輯:王亞冉

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